Nessa época, conheceu Sartre e foi preso novamente, condenado à prisão perpétua. Saiu-se livre graças a um movimento de intelectuais liderados por Jean Cocteau, tendo concluído o romance ‘Nossas Senhora das Flores’, dedicado a Maurice Pilorge, condenado à morte na guilhotina pelo assassinato de seu amante. A peça ‘Alta Vigilância’ foi escrita a lápis no papel que os presidiários recebiam para fazer sacolas. Seu livro mais conhecido é ‘Diário de um Ladrão’, publicado em 1949. No ano seguinte, escreveu ‘Querelle de Brest’, que, em fins da década de 70, foi adaptado para o cinema por Werner Fassbinder e estrelado por Brad Davis. Afirma-se que Genet perturbou tanto o diretor durante o período de filmagens, que apressou sua morte.

Em 1970, o escritor esteve em São Paulo para assistir à montagem de sua peça ‘O Balcão’, no teatro Ruth Escobar. ‘Cheguei, sentei e dormi’, diria ele mais tarde. Nos anos 60, participou de movimentos contra o racismo e, em 1977, saiu em defesa dos terroristas alemães Baader e Meinhof, condenados a morte. ‘Sou o intérprete do resíduo humano. A sociedade, como vocês a fizeram, eu a detesto’, afirmou. Faleceu aos 75 anos, em 18 de abril de 1986.